Nguồn gốc của Batchoy hiện vẫn còn mơ hồ. Có nhiều tài liệu nói về nguồn gốc khác nhau của món ăn này:
Món ăn được chế biến trong công thức của người tạo ra món súp này[3] được gọi là hỗn hợp nước dùng, mì, thịt bò và thịt heo. Súp sau đó phát triển thành món ăn như ngày hôm nay và trở thành món ăn phổ biến nhất của thành phố Iloilo. Federico Guillergan, Jr., con trai của nhà phát minh món súp này nói rằng: cha ông lúc đầu đã gọi đùa món ăn là "dơi" khi được hỏi tên của nó. Sau đó, ông đã thêm thêm từ "choy", từ món chop suey.[4]
Teodorico Lepura đã mở cửa hàng món súp này đầu tiên tại chợ La Paz vào năm 1945. Được điều hành bởi Lepura, vợ và các con của anh. Tại thời điểm đó, món súp này được bán với giá 20 centavos mỗi bát. Những năm 1930, khi còn là thiếu niên, Lepura đã học được những cách chế biến cơ bản khi làm việc cho một thương gia Trung Quốc, và cuối cùng đã chế biến ra món ăn mới cho riêng mình.[1]
